蛋白质是哈士奇生命活动的基础，占“干”体重的一半，是体内除水分以外含量最多的物质。体内的各种组织器官，参与物质代谢的各种酶类，及抗体都是由蛋白质组成的。在肌体损伤时，蛋白质的需求量更加大，用来修复细胞和器官。

构成蛋白质的基本物质是氨基酸。食物中的蛋白质经消化而转变为氨基酸后才能被机体吸收利用。氨基酸可分为必需氨基酸和非必需氨基酸。必需氨基酸是指犬自身不能产生或产生不足的氨基酸，必须从食物中吸取。非必须氨基酸是指可以从其他氨基酸转换而来的。在营养缺乏时，非必须氨基酸的合成要消耗必须氨基酸。所以在配置食物时，要注意营养搭配，不要只途数量。

蛋白质缺乏，会使犬体内蛋白质代谢失去平衡，引起食欲下降、体重减轻、生长缓慢、血液内蛋白质含量降低，使免疫力降低。公犬精液品质下降、精子数量减少。母犬发情异常、不受孕，即使受孕，胎儿也常因发育不良而发生死胎或畸胎。但过量饲喂蛋白质不但造成浪费，也会引起体内代谢紊乱，使心脏、肝脏、消化道、中枢神经系统机能失调，性机能下降，严重时发生酸中毒。一般情况下，成年犬每天每千克体重约需48克蛋白质，而生长发育时期的幼犬约需9。6克。